魚菜共生系統(tǒng)中，水面上可以種植睡蓮、荷花等水生花卉。這些花卉不僅能夠美化環(huán)境，還能為魚類提供遮蔭和棲息地。
除了水生花卉，在水面還可以種植一些漂浮植物如浮萍、鳳眼蓮（盡管鳳眼蓮生長(zhǎng)迅速，需謹(jǐn)慎控制其數(shù)量以免過(guò)度繁殖）。這類植物根系懸浮在水中，可以吸收水中的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)，有助于凈化水質(zhì)，為魚類創(chuàng)造更好的生活環(huán)境。同時(shí)，它們也能起到一定的裝飾作用，使魚菜共生系統(tǒng)更加美觀。
另外，像菖蒲這樣的濕生花卉也可以種植在魚菜共生系統(tǒng)的邊緣地帶或者淺水區(qū)。菖蒲具有較強(qiáng)的適應(yīng)性和凈化能力，它能夠有效去除水中的有害物質(zhì)，如氨氮等，促進(jìn)整個(gè)系統(tǒng)的生態(tài)平衡。需要注意的是，在選擇種植的花卉時(shí)，要確保它們與所養(yǎng)魚類相容，不會(huì)對(duì)魚類造成傷害或被魚類大量啃食，影響花卉的正常生長(zhǎng)。
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